Episódios
1ª temporada
* Josh Groban participa do 3º episódio ("Acafellas") e retorna no 22º ("Journey"), como ele mesmo; Kristin Chenoweth participa do 5º ("The Rhodes Not Taken") e do 16º ("Home") episódios como April Rhodes; Olivia Newton-John participa do episódio 17 ("Bad Reputation") e retorna no 22º ("Journey"), como ela mesma.
Pilot
Will Schuester é professor de espanhol na McKinley High School, e decide assumir o glee club da escola depois que o antigo responsável é demitido. Para isso, ele precisa pagar, já que o diretor considera que o clube não oferece qualquer benefício para a escola; por ter sido membro quando estudava e desejar que ele volte aos seus tempos de glória, Will aceita. O Novas Direções é primeiramente composto por Rachel Berry, Mercedes Jones, Kurt Hummel, Tina Cohen-Chang e Artie Abrams. Quando Will descobre que Finn Hudson, o quarterback do time de futebol americano da escola, tem um talento secreto para cantar, o convence a entrar no clube. Ken Tanaka, treinador do time e amigo de Will, está interessado em Emma Pillsbury, a orientadora da escola, mas percebe que ela está interessada no amigo, que é casado. Terri, esposa de Will, usa a descoberta de uma gravidez para pedir a Will que procure um emprego em que ganhe melhor. Ele considera a ideia, mas depois de conversar com Emma e ver uma apresentação dos membros do clube, escolhe permanecer na escola.
Showmance
O Novas Direções se apresenta para a escola pela primeira vez, em uma tentativa de atrair novos membros, pois eles descobrem que só podem competir com, no mínimo, doze. Will arruma um segundo emprego na escola, que acaba lhe aproximando de Emma. Ela se assusta com essa aproximação e, como forma de se afastar dele, aceita sair com Ken. Terri descobre que sua gravidez é psicológica, mas não tem coragem de contar isso para Will e acaba inventando que eles terão um menino. As líderes de torcida Santana Lopez, Brittany Pierce e Quinn Fabray, namorada de Finn, entram para o clube por ordem da treinadora Sue Sylvester, que deseja acabar com ele. Enquanto isso, Rachel e Finn beijam-se durante um ensaio, mas ele decide que não irá deixar Quinn.
Acafellas
Will forma uma boyband de a cappella chamada Acafellas, e acaba por negligenciar o glee club. Depois que dois membros deixam a Acafellas, Finn e seu companheiro de futebol americano Puck, entram na banda. Sandy Ryerson, ex-responsável pelo glee também entra, pois garante que fará com que Josh Groban esteja na próxima apresentação. Durante a ausência de Will, os membros do clube contratam um famoso coreógrafo para treiná-los, como sugestão das líderes de torcida, que esperam que o rigor faça alguns abandonarem o grupo. Mercedes começa a ter sentimentos românticos por Kurt, mas se magoa quando ele lhe diz que é gay. Will percebe que sua paixão é ensinar, não se apresentar, e volta a dar atenção para o Novas Direções.
Preggers
Kurt entra para o time de futebol americano, em uma tentativa de impressionar seu pai. Quinn descobre que está grávida e diz a Finn que o bebê é dele, quando na verdade é de Puck. Finn pede a Will que ensine o time a dançar, esperando que isso os ajude a ganhar o jogo e aumente suas chances de receber uma bolsa de estudo. Terri conta a sua irmã que não está grávida de verdade, e esta sugere que ela continue fingindo e depois consiga um bebê. Puck, Mike Chang e Matt Rutherford entram no glee clube, o que os deixa com os doze membros necessários para competir. Kurt conta para seu pai que é gay. Sue e Sandy unem-se para tentar destruir o clube, e conseguem tirar Rachel, que se irrita quando Will oferece um solo que ela queria para Tina.
The Rhodes Not Taken
Will, tentando encontrar um décimo-segundo membro que substitua Rachel, recruta uma antiga estrela do clube, April Rhodes - que havia se tornado alcoólatra. Finn flerta com Rachel, em um esforço para fazê-la voltar. Ele a leva para um encontro, no qual os dois se beijam. Rachel acaba retornando, mas se irrita ao descobrir que Quinn está grávida e vai embora novamente. Will percebe que o lugar de April não é no clube, e a encoraja a manter-se sóbria e ir atrás de seu sonho de se apresentar na Broadway. A saída de April faz com que Rachel acabe decidindo fazer seu segundo retorno.
Vitamin D
Will promove uma competição entre os garotos e as garotos do glee club, no qual devem apresentar um mash-up de duas canções. Terri torna-se a enfermeira do colégio, no intuito de vigiar Will e Emma. Ken pede Emma em casamento, após o incentivo de Terri, e ela, mesmo relutante, acaba aceitando. Terri entrega pílulas de vitamina D para os membros do clube, o que acaba melhorando suas performances. Ambos os lados confessam, o que anula a competição. Terri é demitida e Sue torna-se co-diretora do clube. Quinn aceita deixar que Terri adote seu bebê quando ele nascer, o que permite que ela continue fingindo que está grávida.
Throwdown
Will e Sue não conseguem se entender como co-diretores. Sue tenta destruir o clube, sugerindo que Will está negligenciando as minorias para colocá-los uns contra os outros. Quando o repórter da escola, Jacob Ben Israel, descobre que Quinn está grávida, Rachel tenta impedi-lo de contar para o resto da escola, mas Sua o obriga a publicar. Terri chantageia seu médico para fingir que ela está grávida de verdade quando Will a acompanha na ultra-som. Depois de protestos, Sue abandona o cargo de co-diretora do glee club.
Mash-Up
Will fica responsável por criar um mash-up para o casamento de Ken e Emma. Ken torna-se muito ciumento com relação a Emma e Will e tenta forçar os membros do clube e do futebol americano a escolher entre os dois, mas depois cede. Quinn e Finn percebem que não são mais populares entre os alunos da escola, por estarem no glee clube. Rachel e Puck têm um breve relacionamento, mas seus sentimentos por Finn e Quinn, respectivamente, faz com que se separem. Sue torna-se mais amigável quando começa a sair com o âncora Rod Remington, até que descobre que ele a estava traindo. Ela então retira Quinn das líderes de torcida, por estar grávida.
Wheels
Os membros do clube começam a vender bolinhos, com o objetivo de arrecadar dinheiro para o aluguel de um ônibus especial para que Artie, que é paraplégico, possa viajar com eles para as distritais, e não de carona com o pai. Quinn precisa de dinheiro para os gastos com a gravidez, e Puck se oferece para ajudá-la. O diretor Figgins obriga Sue a fazer audições abertas para a escolha de novas líderes de torcida, e ela escolhe Becky Jackson, uma aluna com síndrome de down. Kurt deseja um solo de "Defying Gravity", tradicionalmente cantada por uma mulher, que é dado a Rachel. Os dois fazem uma competição para decidir qual deles irá ganhá-lo. Depois que Burt, pai de Kurt, recebe uma ligação anônima na qual o filho é ofendido por ser gay, ele decide perder de propósito, para não expor mais o seu pai. Artie e Tina se beijam, mas ele se chateia quando ela confessa que apenas fingia ser gaga, pois sentia que isso os dava algo em comum.
Ballad
Will sorteia pares entre os membros do clube, para cantarem uma balada juntos. Como Matt Rutherford não está presente, ele é forçado a colocar o seu nome e fazer um dueto com Rachel, que desenvolve uma paixão por ele. Will tenta desencorajá-la gentilmente, lembrando-se de uma estudante que havia se apaixonado por ele e, depois que disse que nada seria possível entre os dois, tentou se matar. Finn conta para os pais de Quinn que os dois terão um filho, e o pai dela a expulsa de casa. Ela vai, então, morar com Finn e sua mãe. Puck conta para Mercedes que ele é o verdadeiro pai do bebê que Quinn está esperando e ela diz para que ele deixe Quinn em paz, já que ela havia escolhido Finn como pai.
Hairography
Will desconfia que Sue está armando algo para prejudicar o clube junto com seus rivais nas Seccionais, o que o leva a se encontrar com os diretores dos outros clubes. O clube da Jane Addams Academy, formada por garotas que estiveram no reformatório, acaba se apresentando no auditório deles e Will ficam intimidado com sua "cabelografia", mas Rachel lhe diz que é a técnica é apenas uma distração, pois seus vocais e dança não são muito bons. Os alunos da Dalton Rumba, uma escola para surdos, também visitam o New Directions, e os dois se juntam em uma apresentação de "Imagine". Apesar disso, Sue se reúne depois com os dois diretores e os convence a imitarem a tracklist do glee club na competição, para que eles sejam prejudicados. Enquanto isso, Quinn decide dá uma chance a Puck, para saber se ele poderia ser um bom pai para seu bebê e usa Rachel como uma distração para Finn. Kurt finge ajudar Rachel a atrair Finn, mas, na verdade, tenta afastá-lo dela.
Mattress
Enquanto luta para que o clube ganhe um espaço no anuário da escola, Rachel consegue que os alunos do glee gravem um comercial para uma empresa de colchões, sem o conhecimento de Will. Eles são pagos em colchões, e receber pagamento por um serviço faria com que não fossem mais considerados amadores e fossem desclassificados da competição. Depois de descobrir que Terri estava fingindo a gravidez, Will encontra os colchões na escola e dorme em um deles. Quando descobre o que havia acontecido, ele diz que não poderá acompanhá-los na competição, já que foi ele quem aceitou o pagamento ao dormir no colchão, e não eles, que poderiam competir se não fizesse parte. Emma e Ken marcam seu casamento para o mesmo dia das Distritais.
Sectionals
O New Directions vai para as Seccionais, e tiram o primeiro lugar, apesar de Sue ter repassado a lista de músicas para os clubes rivais, e eles improvisam tudo de última hora. Enquanto isso, Finn descobre que o pai do bebê de Quinn é Puck, Ken não comparece ao seu casamento e deixa Emma desolada, Will e Terri terminam e Emma e Will começam a namorar
Hell-O
O episódio que marca a volta da série terá várias músicas de nome Hello,ou relacionadas a isso. Sue está de volta para aterrorizar o clube e novos personagens entrarão na história,como o cantor principal do Vocal Adrenaline, Jesse St. James(Jonathan Groff) e a professora do mesmo coral,interpretada por Idina Menzel. Finn termina com Rachel, tem encontro com Santana e Britanny mas quando ele quer Rachel de volta já é tarde pois ela já está namorando Jesse. Pressionada pelo clube, finge que termina com Jesse mas não é verdade.
The Power of Madonna
O episódio conta apenas canções de Madonna. Rachel com Jesse, Emma com Will e Finn com Santana tentam perder a virgindade, mas não conseguem pois ainda não estão prontos, com exceção de Will. Jesse sai do Vocal Adrenaline para poder namorar Rachel, e Finn não gosta da ideia.
Home
Kurt arranja um encontro para o Pai com a mãe do Finn, em espera que eles fiquem mais proximos. Sue obriga as Cheerios a fazer uma dieta para uma entrevista de uma revista a ameaça a tirar Mercedes do grupo.
Bad Reputation
Os garotos do clube do coral estão com má reputação em toda escola. Isso acontece por causa de um vídeo de Sue dançando uma canção de Olivia Newton-John que eles colocaram no YouTube e uma lista secreta feita por um deles apontando os mais sexys do clube. Ao perceber tudo isso, Rachel decide produzir um vídeo para fazer sua má reputação aumentar. Mal sabem eles que essas coisas que andam fazendo terão resultados surpreendentes.
Laryngitis
Will pede pra que cada aluno cante uma música que expresse o momento em que eles estão vivendo. Rachel descobre que tem Laringite, e Finn apresenta ela á um velho amigo dele chamado Sean, que é tetraplégico, e ajuda Rachel á superar a laringite. Enquanto isso, Puck raspa o moicano e todos na escola zoam ele, e ele percebe que pra voltar a ser popular, terá que começar a namorar Mercedes, o que causa muito ciúmes em Santana, e no final, Mercedes abandona as Cherios, por conta das atitudes de Puck.
Dream On
Artie emenda o relacionamento com Tina e lida com a sua condição física. Bryan Ryan (Neil Patrick Harris), o antigo rival do tempo de escola de Will, retorna. Jesse ajuda Rachel a encontrar sua mãe, que mandou uma pista para Rachel: uma fita em que ela canta.
Theatricality
Novas Direções ensaiam apresentações mais "teatrais", como apresentações à Lady Gaga e Kiss. A mãe do Finn decide morar com o pai do Kurt, mas alguns problemas entre Finn e Kurt começarão a surgir. Rachel descobre quem é a sua mãe e o encontro com as duas é emocionante.
Funk
Jesse termina com Rachel e volta para o Vocal Adrenaline. Enquanto isso, Will prepara um número de Funk, pois o Vocal Adrenaline nunca conseguiu fazer um número de Funk, e isto os deixa furiosos. Além de Quinn se conectar com o seu lado Funk com a ajuda de Mercedes, Will se vinga de todas as coisas malvadas de Sue.
Journey
New Directions compete contra Vocal Adrenaline nas Regionais. Os juízes são Olivia Newton-John, Josh Groban e Sue. Surpreendentemente, Sue vota para que o New Directions fique em primeiro lugar, mas eles acabam perdendo. Quinn tem seu bebê, chamada Beth a pedido de Puck, e Shelby adota Beth. Sue chantegeia o diretor Figgins e os garotos ganham mais um ano, pois se eles não vencessem as regionais, o Glee seria fechado.
2ª temporada
* Britney Spears participa do 2º episódio ("Britney/Brittany") como ela própria; Gwyneth Paltrow participa do 7º episódio ("The Substitute") e retorna no 15º ("Sexy") e no 17º ("Night of Neglect") como Holly Holiday; Kristin Chenoweth, que já havia aparecido na primeira temporada como a alcóolatra April Rhodes, retorna no 19º ("Rumours"); Patti LuPone participa do 22° episódio ("New York") como ela mesma; Jonathan Groff, que também esteve na primeira temporada, participa dos três últimos episódios ("Prom Queen", "Funeral" e "New York") como Jesse St. James.
Audition
Após perderem as Regionais, o Glee Club está de volta ao nível mais baixo da McKinley High. Quando a escola se vê frente a novos cortes de orçamento, devido ao fato da nova treinadora de futebol pedir mais orçamento para o time, Mr. Schuester pressiona os alunos a ajudarem a recrutar novos membros para o clube. Enquanto Finn tenta trazer Sam, um aluno novato, Rachel tenta impedir que Sunshine entre, por medo de perder os seus solos. No fim, Sam não tem coragem de fazer a audição e Sunshine é transferida e entra no Vocal Adrenaline. Tina termina com o Artie e ele pede ajuda à Finn para entrar no time de futebol para reconquistá-la, mas a nova treinadora acha que é uma brincadeira e tira Finn do time. Enquanto isso, Quinn volta para as líderes de torcida.
Britney/Brittany
Quando Brittany e os demais membros tentam convencer Mr. Schuester a deixá-los executarem um número da Britney Spears, ele fica relutante, por achar que ela não é um bom exemplo. Enquanto isso, um inseguro Will está curioso sobre o novo namorado de Emma, Dr. Carl Howell, então ele convence Emma a trazê-lo para a escola para conversar com os garotos sobre higiene dental. Enquanto o doutor inspira as garotas a levar sua higiene pessoal mais a sério, Will passa a se sentir pior consigo mesmo. Brittany tem um sonho enquanto está anestesiada, em que ela canta uma música de Britney Spears. Ela conta pra Santana, que também leva uma anestesia e tem um sonho com Brittany. A partir daí, as duas passam a ser mais decididas. E não são só as duas que têm sonhos: Artie e Rachel também têm, e começam a ver as coisas de um modo diferente. Will finalmente cede, e eles aprensentam "Toxic" para a escola. Sue acha ruim, liga o alarme de incêndio e deixa todos apavorados. Mesmo com protestos de Kurt, eles desistem de apresentar Britney Spears.
Grilled Cheesus
Finn tem uma crise existencial quando ele acredita que vê o rosto de Jesus em seu sanduíche de queijo grelhado. Ele passa a orar para ele e sugere que o Glee tenha uma semana dedicada a músicas religiosas. Kurt, que é ateu, não concorda. Apesar disso, quando seu pai tem um infarto, os membros cantam para tentar fazer com que ele melhore. Mas Kurt não gosta do que o Glee está fazendo, e reclama com o diretor Figgins, que proíbe isso. Sue também se questiona sobre o que acredita, e conversa sobre isso com sua irmã Jean. Finn ora para o sanduíche, e pede para ser o novo quarterback. Sam então machuca o ombro e Finn vira o quarterback. E ele novamente ora, pedindo para tocar nos seios da Rachel; eles conversam e ela permite o toque. Mas ele se sente mal por Sam ter se machucado, e pede conselhos a Emma, que diz a ele que não existe nada de especial no sanduíche. Finn canta, no clube do coral, uma canção sobre perder sua fé. Alguns alunos do clube do coral ficam indignados, se perguntando se estavam proibidos de cantar músicas religiosas, mas não de cantar músicas sobre perder a religião. Kurt mostra a todos, cantando "I Want To Hold Your Hand", o quanto sente falta de seu pai, que melhora milagrosamente.
Duets
Depois que Puck é preso, Will organiza uma competição entre os integrantes do clube, valendo um jantar pago em um restaurante para os dois que cantarem o melhor dueto. Rachel convence Finn a desistir de tentar ganhar para fazer com que Sam vença e se sinta parte do clube, cantando, assim, uma música chata e ofensiva. Enquanto isso, Kurt canta sozinho, cantando como homem e mulher ao mesmo tempo. Santana e Mercedes cantam juntas, e Tina e Mike cantam um ótimo dueto. Enquanto isso, Artie e Brittany começam a desenvolver um romance. Sam e Quinn vencem, e vão ao restaurante, e Quinn diz a Sam que ele deve pagar, por ser um cavalheiro e que aquilo era um "primeiro encontro".
The Rocky Horror Glee Show
Mr. Schue faz o Glee Club performar "The Rocky Horror Show" para o musical anual da McKinley, ao saber que é a peça preferida de Emma. Eles encontram dificuldades por algumas pessoas acharem que a peça é forte demais para ser apresentada em uma escola. Finn não quer atuar, pois terá que ficar só de cueca em várias cenas, e tem vergonha de seu corpo. Mas Rachel o ajuda a superar isso. Para "adaptar-se ao figurino", Finn decida andar só de cueca pela escola, o que causa complicações com Figgins. Sue tenta se aproveitar disso para denunciar o clube por conteúdo inadequado, mas falha, já que Will decide cancelar a apresentação para a escola e fazer apenas para eles mesmos.
Never Been Kissed
Will organiza uma competição entre os garotos e garotas do clube, em que cada grupo terá que cantar um mash-up com canções típicas do sexo oposto. Finn e Sam descobrem como "esfriar" as coisas quando estão "namorando": pensar na treinadora Beiste em momentos e roupas constrangedoras, e logo os meninos (e, estranhamente, Tina) estão fazendo isso. Will fica sabendo disso, e acha que, se Beiste souber, ficará muito magoada, e mantém segredo. Enquanto isso, Kurt passa por dificuldades com a perseguição de Dave Karofsky. Kurt visita a Dalton Academy, um internato para meninos, que será o concorrente nas Distritais. Lá, Kurt conhece Blaine, que também é gay e ajuda Kurt, incentivando-o a enfrentar Karofsky. Kurt o enfrenta no vestiário masculino, deixando Karofsky muito bravo, tanto que Dave beija Kurt, em um possível momento de confusão. Puck tenta ajudar Artie como forma de não ter que voltar para o reformatório. Will não aguenta mais, e conta a Beiste o que os meninos (e Tina) estavam fazendo. Beiste fica tão magoada que se demite, provocando grande alegria em Sue, que tem seu orçamento reparado. Mas Will conversa com Beiste, e ela diz que nunca foi beijada, por ser considerada esquisita, e Will a beija, fazendo-a pedir readmissão.
The Substitute
Quando Mr. Schuester fica doente, uma professora substituta dá aulas de espanhol e, a pedido de Kurt, comanda o Glee Club, conseguindo assim conquistar todos do "New Directions", deixando-os cantar o que quiserem. Enquanto isso, quando o Diretor Figgins também fica doente, Sue é nomeada a nova diretora e usa o seu poder na escola, proibindo os bolinhos de batata, o que causa grande revolta em Mercedes. Rachel conta a Will que a substituta está comandando o Glee Club, e Will tenta ter o emprego de volta. Mas Sue, como diretora, demite Will e promove a substituta, Holly Holiday, como a professora de espanhol e nova diretora do Glee Club. Enquanto isso, Mercedes fica com ciúmes de Kurt, que passa muito tempo com Blaine, e tem ilusões, pois está com muita falta dos bolinhos de batata. Em protesto, ela enfia bolinhos de batata no carro de Sue, que fica muito nervosa com os estragos no carro. Assim ela demite Holly, por Mercedes ser sua aluna. Karofsky aborda Kurt no corredor, pergunta se ele falou para alguém sobre o beijo e o ameaça, dizendo que vai matá-lo caso ele conte a alguém. Sue é, então, promovida a diretora permanentemente, pois muitos pais aprovaram sua iniciativa de lanches saudáveis, e o Conselho Estudantil despede Figgins. Sue tenta demitir Beiste, mas não consegue, pois sem o time de futebol as Cheerios não poderiam torcer para ninguém. Will volta a seu cargo, e pede ajuda de Holly para modernizar "Singing in the Rain". Ela faz isso, criando um mash-up de "Singing In the Rain" e "Umbrella".
Furt
Kurt inicia a organização do casamento de seu pai, Burt, com a mãe de Finn, Carole, e continua passando por problemas com um homofóbico; alguns membros do clube e Burt tentam ajudar, enfrentando Karofsky. Enquanto isso, Finn tenta provar que ainda é um líder, depois de ter perdido a posição de quarterback para Sam. Quando sabe que Rod, jornalista com quem havia saído, vai se casar, Sue decide fazê-lo também, com ela mesma, e sua mãe, Doris, aparece para uma visita surpresa.
Special Education
Chegaram as Distritais. Este ano, a competição inclui The Hipsters e Dalton Academy Warblers. Com Kurt na Dalton Academy, o New Directions recruta Lauren Zizes, graças à Puck, como décima segunda membro, para poder competir. Com o conselho de Emma, Will utiliza membros que pouco destacaram nas outras apresentações do clube, para dar a todos uma oportunidade, mas Rachel, Finn e Mercedes não concordam. Santana canta Valerie e Sam e Quinn cantam "The Time Of My Life" na competição. Rachel conta para Finn que ainda é virgem e diz que eles estão se guardando um para o outro. Mas Santana conta para ela que Finn havia mentido sobre não ter perdido a virgindade com ela no ano anterior. Rachel beija Puck como vingança, mas depois se arrepende e conta o que havia feito para Finn, que termina com ela, pois considera que perdeu a virgindade quando estava separado de Rachel, mas ela beijou Puck enquanto estavam namorando. O New Directions vence as distritais.
A Very Glee Christmas
Finn tenta trazer um pouco do Natal para McKinley. Artie descobre que Brittany ainda acredita no Papai Noel e pede ajuda ao clube para que ela não se decepcione, o que se torna mais difícil quando ela pede que ele volte a andar. Enquanto isso, os professores sorteiam seus amigos secretos e Sue manipula para que todos tirem seu nome. Quando eles descobrem e pegam os presentes de volta, ela estraga toda a decoração do Glee Club e os pega de volta, por vingança. A treinadora Beiste faz com que o pedido de Brittany se realize, na medida do possível. Sue e o Glee Club passam o natal com Mr. Schuester.
The Sue Sylvester Shuffle
Mr. Schuester e a treinadora Beiste elaboram um plano para reunir o coral e a equipe de futebol do McKinley High e tentar resolver as diferenças entre os grupos. Enquanto isso, Sue tenta desesperadamente ganhar as Nacionais, lançando um plano perigoso para conseguir trazer o troféu para casa. Quando é impedida de fazer o que deseja pelo Diretor Figgins, ela se irrita e consegue mudar o dia em que as Nacionais das líderes de torcida será realizada para o mesmo da final do campeonato de futebol americano. Então os membros do Novas Direções realizam uma performance com o mash-up de "Thriller" e "Heads Will Roll" durante o intervalo do jogo e as líderes de torcida que fazem parte do clube têm que escolher entre os dois. Depois Quinn agradece a Finn por tê-la aconselhado a optar pelo Glee Club e o beija.
Silly Love Songs
Chegou o Dia dos Namorados. Quinn e Finn ficam muito próximos, colocando em risco o namoro dela com Sam. Rachel revela para Finn que ainda o ama, mas ele tem seus olhos em Quinn. Puck percebe que está apaixonado por Lauren, mas não será tão fácil assim conquistá-la. Enquanto isso, Blaine diz que está apaixonado por alguém e Kurt acha que é ele, mas acaba se decepcionando. Santana fala o que quer para o Glee Club, mas acaba ouvindo o que não quer. Ela então briga com Lauren e, para se vingar de todos, beija um garoto que tem mononucleose, uma doença a qual ela é imune, e logo depois beija Finn, que, sem saber, a passa para Quinn, deixando os dois doentes e a suspeita de que tenham se beijado. Kurt convida o Glee para uma festinha do Dia dos Namorados.
Comeback
Emma acha o diário de Sue e acha que ela pode tentar se matar. Com a ajuda de Will, a encontram antes que isso aconteça. Em sua tentativa de ajudar, Mr. Schue convida Sue para participar do Novas Direções. Dentro do clube, ela tenta "destruí-lo por dentro", armando intrigas entre os membros. Depois, Will a leva para visitar e cantar com crianças doentes em um hospital. Rachel tenta se lançar entre a classe dos populares do McKinley High com uma pequena ajuda de Brittany. Enquanto isso, Sam dá início a uma Experiência Justin Bieber, para tentar reconquistar Quinn. Vendo que a idéia está agradando as garotas, outros membros do clube decidem participar também. Sue sugere uma canção para ser cantada por todos, inclusive por ela, e eles querem cantá-la nas Regionais, apesar de Rachel sugerir que escrevam uma canção inédita. Santana convence Sam de que Quinn o havia traído e, apesar dela ter decidido deixar Finn e dito que queria ficar com ele, termina com ela e passa a sair com Santana.
Blame It on the Alcohol
O diretor Figgins organiza uma semana para alertar o corpo estudantil a respeito dos perigos do uso de álcool por menores de idade e convida o Novas Direções para uma apresentação que o ajude nessa campanha. Mas alunos do clube organizam uma festa na casa de Rachel, onde acabam bebendo demais e fazendo um "jogo da garrafa", onde Rachel e Blaine se beijam. Ela passa então a se interessar por ele, que está confuso com relação a sua sexualidade e decide "experimentar", o que não agrada a Kurt. Enquanto isso, Schuester e Beiste iniciam uma pequena diversão em um CountryBar, onde ele acaba bebendo demais e em uma confusão liga para Sue, achando que é Emma e se declara. Aproveitando a situação, Sue grava o que ele diz. Para disfarçar a ressaca, Rachel prepara uma mistura de várias bebidas para eles tomarem antes da apresentação para a escola, o que não cai muito bem para Brittany, que vomita em cima dela no palco. Apesar do que aconteceu, o clube recebe um "parabéns" do diretor, que informa que o acontecido na apresentação assustou os alunos e não estão tendo mais problemas com excesso de bebidas na escola. Sue, para humilhar Will, utiliza a rádio da escola em horário de aula e coloca a gravação para todos ouvirem o que ele falou.
Sexy
Holly Holliday retorna ao McKinley High como professora substituta de Sexologia e Will parece vê-la com outros olhos. Emma passa a organizar o Clube do Celibato, enquanto discute com Carl algumas questões sobre sua vida pessoal. Enquanto isso, Holly incentiva Santana a se abrir para sua bissexualidade. Lauren beija Puck e os dois decidem fazer um vídeo de sexo, mas Holly os convence a desistir. Santana confessa seus sentimentos para Brittany e diz que só quer ficar com ela, mas Brittany prefere Artie. Holly pergunta a Emma se ela ainda está apaixonada por Will e ela não consegue responder, o que faz com que Carl se irrite e provoca um rompimento entre os dois.
Original Song
Com as Regionais se aproximando, Will recebe uma carta dizendo que eles não poderão apresentar "Sing", como tinham planejado. Ele pede então ideias para os integrantes do New Directions. Rachel novamente sugere que eles cantem canções originais e o grupo inicialmente discorda, até que Quinn a apoia e convence os outros, se oferecendo para compor uma canção com ela. Mas, ao apoiar Rachel, Quinn estava apenas colocando em prática o seu plano de mantê-la por perto, para impedir que ela estrague seus planos de voltar com Finn e de ser a Rainha do Baile. Enquanto isso, na Dalton Academy, Kurt reclama com Blaine sobre o fato de todos os solos serem dele e, logo depois, Pavarotti, o canário que lhe foi dado para que cuidasse, tem um derrame. No dia seguinte, na reunião dos Warblers, Kurt vai vestido de preto, e informa que está de luto pela morte do canário. Assim, ele apresenta "Blackbird". Blaine sugere para todos que os dois cantem um dueto nas Regionais, o que é aceito. No Colégio McKinley, Santana encontra Brittany perto dos armários, e diz que não terminou seu namoro com Sam. Ao abrirem seus armários, as duas são atingidas por barro, colocado lá por Sue. Will começa uma reunião para que o New Directions consiga escrever boas músicas, e depois de alguns fracassos, eles escrevem "Loser Like Me", que expressa a humilhação que eles passam todos os dias, principalmente por causa de Sue. Em um dos ensaios do dueto, Blaine admite para Kurt que só sugeriu que o fizessem para passarem mais tempo juntos, se declara para ele e os dois se beijam. Rachel se encontra com Quinn no auditório para sua composição, onde Quinn diz o que pensa, cruelmente, para Rachel, que diz que não irá desistir de Finn e que vai compor sozinha. Rachel usa seu sofrimento como inspiração para compor, sozinha em seu quarto. Nas Regionais, o Aural Intensity é o primeiro a se apresentar, seguido pelos Warblers; o New Directions é o terceiro. Os juízes se reunem para decidir o vencedor e, quando a esposa do governador, que estava bêbada, anuncia que foi o New Directions, Sue lhe dá um soco. Kurt e Blaine fazem o enterro na Pavarotti, no qual ele diz que lembrou-se do enterro de sua mãe, e lamenta por não terem vencido. Blaine o consola. Rachel e Quinn se acertam. Will decide criar uma votação após todas as competições, na qual os membros votam para eleger quem foi o destaque da noite entre eles; Rachel vence por unanimidade e agradece o apoio dos outros.
A Night of Neglect
O Novas Direções precisa de dinheiro para ir as Nacionais, assim como o grupo de decatlo acadêmico que Artie, Mike, Tina e Brittany formaram, para ir para as finais de sua competição. Holly sugere que eles organizem um show beneficente, no qual irão apresentar apenas canções de artistas que consideram negligenciados, e a ideia é aceita. Enquanto isso, Sue recruta pessoas que têm raiva de Will e/ou do glee club - Sandy, ex-responsável pelo clube, Terri, ex-mulher de Will, e Dustin, treinador do Vocal Adrenaline - para que a ajudem a prejudicá-los; ela os chama de "Liga da Destruição". Sunshine se oferece para se apresentar no show. Rachel a acusa de estar espionando, mas ela nega e diz que pode trazer os seus 600 seguidores no Twitter, o que convence os outros. Lauren diz a Mercedes que ela não está conquistando o respeito dos outros membros do clube, e ela passa a agir como "diva", fazendo várias exigências. Carl entra com um pedido de anulação do casamento com Emma, considerando que este nunca foi consumado, e Will a consola. Pouco antes do show, Blaine, Kurt e Santana têm uma discussão com Karofsky. Os membros do clube descobrem que Sunshine e seus seguidores não vêm, e há poucas pessoas na plateia; ainda assim, se apresentam. Alguns alunos, por ordem de Sue, xingam Tina, a primeira a entrar no palco. Will distribui balas para distraí-los e, durante o intervalo, Holly conversa com eles e mostra que o que estão fazendo é errado. Mercedes desiste de se apresentar, mas Rachel a procura, as duas conversam sobre o que a incomoda e ela decide cantar. Holly termina o namoro com Will. Sandy se arrepende e decide arcar com os gastos da viagem.
Born This Way
Will acha que os alunos do clube do coral não estão muito bem na dança, por isso exige que todos dancem, mas Finn, acidentalmente, quebra o nariz de Rachel. Will usa a música de Lady Gaga para ajudar os membros do clube a se aceitarem. Ele também incentiva Emma a tratar-se, procurando um terapeuta. Lauren passa a competir com Quinn para ser a rainha do baile, enquanto Rachel cogita fazer uma rinoplastia, com a desculpa de melhorar a voz para as Nacionais. Santana descobre o segredo de Karofsky e o usa para convencê-lo a fingir que estão juntos já que são homossexuais, na tentativa de também ter uma chance de tornar-se a rainha do baile. Os dois decidem criar um grupo contra bullying, que irá patrulhar a escolha, como forma de impedir que este aconteça. Ele conversa com Kurt e o convence a retornar para a McKinley High. Kurt recebe uma homenagem dos Warblers. Lauren descobre um segredo íntimo que Quinn vinha tentando esconder e espalha para toda a escola.
Rumours
Brittany lança um programa na internet chamado "Fondue for Two", com o objetivo de receber convidados para fofocar, e Mercedes e Tina são as primeiras convidadas. Durante o programa, ela conta que Santana "joga no outro time". Sue decide reabrir o jornal da escola e publica rumores e invenções. Rachel convida Sam para ir com ela ao baile, mas ele não aceita. April Rhodes retorna para tentar convencer Will a participar de seu novo projeto: um musical escrito por ela mesma, sobre sua vida. Artie e Brittany rompem; ela, então, convida Santana para ir ao seu programa, onde se declararia e a convidaria para ir ao baile com ela. Santana aceita, mas depois desiste. Finn e Quinn passam por problemas de confiança no relacionamento e ela o diz que, se quiser continuar o namoro, não poderá fazer um dueto com Rachel nas Nacionais. O glee club descobre que Sam está passando por sérios problemas financeiros.
Prom Queen
A campanha para rei e rainha do baile torna-se cada vez mais intensa. Quando a banda convidada para o baile não pode comparecer, o diretor Figgins pede ao Novas Direções que fique responsável pelas apresentações, o que desagrada Sue, que está organizando as festividades. Artie quer reconquistar Brittany; ele a convida para ir ao baile, mas ela não aceita e diz que irá sozinha e dançar com os pares dos outros. Mercedes fica chateada por não ter sido convidada para ser a acompanhante de alguém, então Rachel sugere que as duas vão juntas, com Sam, que aceita a ideia depois que lhe dizem que têm todas as despesas resolvidas. Jesse reaparece e conversa com Rachel, pedindo seu perdão; ela aceita que ele vá ao baile com ela, Mercedes e Sam. Jesse e Finn brigam durante o baile, por causa de Rachel, e são expulsos. Karofsky é eleito o rei do baile e Kurt, a rainha. Kurt sente-se ofendido, mas supera com a ajuda de Blaine e decide aceitar a coroação. As candidatas se chateiam por não terem sido eleitas, e Quinn dá um tapa em Rachel, culpando-a pela derrota, mas Rachel reage com delicadeza. Quando a dança entre o rei e a rainha do baile é anunciada, Kurt diz à Karofsky que aquela era a oportunidade perfeita para ele se assumir, mas Karofsky vai embora, e Kurt dança com Blaine, seu acompanhante.
Funeral
Will contrata Jesse para ajudar o New Directions a escolher o que vão apresentar nas Nacionais, mas ele deixa alguns membros irritados com seus comentários (principalmente Finn). Sue conta a Will que sua irmã, Jean, havia falecido, por causa de uma pneumonia. Kurt e Finn conversam com ela e oferecem ajuda para os preparativos do funeral e organização das coisas que eram de Jean em seu quarto no asilo. No funeral, o New Directions faz uma apresentação em homenagem à Jean, com a música "Pure Imagination", do Willy Wonka & the Chocolate Factory. Logo depois do funeral, Finn termina com Quinn para ficar com Rachel, mas depois a vê beijando Jesse. Finn diz que ficou surpreso por Quinn não sair do New Directions por causa do término do namoro e ela responde dizendo que assim o plano dela para Nova York não seria concluído.
New York
O Novas Direções viaja para Nova York para competir nas Nacionais. Como haviam decidido apresentar canções originais e ainda não as tinham escrito, Will diz para ficarem no quarto do hotel para compor. Enquanto isso, ele faz uma visita à Broadway, sem que eles saibam. Sem inspiração, os membros do clube decidem deixar o hotel para explorar a cidade. Incentivado por Puck e Sam, Finn convida Rachel para um encontro. Enquanto estão em um restaurante, eles encontram Patti LuPone, uma conhecida artista da Broadway. Os garotos do glee fazem uma serenata para Rachel e Finn tenta beijá-la, mas ela rejeita. No dia seguinte, ela sai com Kurt e eles visitam o palco de Wicked. Santana e Brittany conversam com Quinn e ela deixa de lado a ideia de sabotar a apresentação nas Nacionais. Os membros do clube descobrem que Will está indo para a Broadway e ficam chateados, mas ele diz que não vai mais embora e eles compõem as canções juntos. A competição começa, com 50 clubes concorrendo. Sunshine e Rachel conversam. Antes de entrarem no palco, Rachel diz para Finn que ainda está interessada nele, mas que seu sonho de ser uma artista famosa é sua prioridade. Mesmo assim, eles se beijam depois do seu dueto, diante da plateia. Depois, Jesse diz que os juízes não irão gostar do beijo e isso irá lhes custar as Nacionais, mas Finn diz que ele está apenas com ciúmes. Depois que a lista com o top 10 é divulgada, eles descobrem que não estão nela, pois terminaram na 12º posição. Depois do retorno para Ohio, Kurt sai com Blaine para falar sobre o que havia acontecido e eles encontram-se com Sam e Mercedes, que estão saindo juntos secretamente. Finn sente-se culpado por ter beijado Rachel no palco, mas ela o consola. Ela repete que irá optar pela carreira quando chegar a hora, mas ele diz que ainda falta um ano para terminarem a escola e os dois se beijam novamente.
3ª Temporada : Em breve !
